Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GP1BBP13224 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GP1BBP13224 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GP1BBP13224 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GP1BBP13224 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GP1BBP13224 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GP1BBP13224 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GP1BBP13224 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GP1BBP13224 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GP1BBP13224 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GP1BBP13224 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GP1BBP13224 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GP1BBP13224 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GP1BBP13224 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GP1BBP13224 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GP1BBP13224 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GP1BBP13224 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
GP1BBP13224 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GP1BBP13224 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GP1BBP13224 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GP1BBP13224 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GP1BBP13224 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
GP1BBP13224 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
GP1BBP13224 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GP1BBP13224 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GP1BBP13224 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GP1BBP13224 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GP1BBP13224 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GP1BBP13224 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GP1BBP13224 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GP1BBP13224 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GP1BBP13224 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GP1BBP13224 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GP1BBP13224 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GP1BBP13224 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GP1BBP13224 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GP1BBP13224 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GP1BBP13224 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GP1BBP13224 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GP1BBP13224 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GP1BBP13224 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GP1BBP13224 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GP1BBP13224 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GP1BBP13224 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GP1BBP13224 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GP1BBP13224 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GP1BBP13224 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GP1BBP13224 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GP1BBP13224 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GP1BBP13224 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GP1BBP13224 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GP1BBP13224 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GP1BBP13224 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GP1BBP13224 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GP1BBP13224 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GP1BBP13224 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GP1BBP13224 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GP1BBP13224 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GP1BBP13224 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GP1BBP13224 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GP1BBP13224 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
GP1BBP13224 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GP1BBP13224 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GP1BBP13224 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GP1BBP13224 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GP1BBP13224 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GP1BBP13224 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GP1BBP13224 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GP1BBP13224 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GP1BBP13224 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
GP1BBP13224 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
GP1BBP13224 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
GP1BBP13224 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GP1BBP13224 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GP1BBP13224 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GP1BBP13224 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GP1BBP13224 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GP1BBP13224 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GP1BBP13224 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GP1BBP13224 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GP1BBP13224 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GP1BBP13224 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GP1BBP13224 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GP1BBP13224 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GP1BBP13224 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GP1BBP13224 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GP1BBP13224 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GP1BBP13224 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GP1BBP13224 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GP1BBP13224 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GP1BBP13224 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GP1BBP13224 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GP1BBP13224 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GP1BBP13224 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GP1BBP13224 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GP1BBP13224 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GP1BBP13224 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GP1BBP13224 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.02■□□□□ -0
GP1BBP13224 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GP1BBP13224 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms