Protein–RNA interactions for Protein: P0DN76

U2AF1L5, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit-like protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF1L5P0DN76 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
U2AF1L5P0DN76 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC21.3■■□□□ 1
U2AF1L5P0DN76 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
U2AF1L5P0DN76 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
U2AF1L5P0DN76 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
U2AF1L5P0DN76 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
U2AF1L5P0DN76 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
U2AF1L5P0DN76 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
U2AF1L5P0DN76 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
U2AF1L5P0DN76 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
U2AF1L5P0DN76 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
U2AF1L5P0DN76 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
U2AF1L5P0DN76 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
U2AF1L5P0DN76 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
U2AF1L5P0DN76 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
U2AF1L5P0DN76 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
U2AF1L5P0DN76 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
U2AF1L5P0DN76 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
U2AF1L5P0DN76 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
U2AF1L5P0DN76 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
U2AF1L5P0DN76 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
U2AF1L5P0DN76 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
U2AF1L5P0DN76 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
U2AF1L5P0DN76 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC21.29■■□□□ 1
U2AF1L5P0DN76 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
U2AF1L5P0DN76 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
U2AF1L5P0DN76 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
U2AF1L5P0DN76 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
U2AF1L5P0DN76 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
U2AF1L5P0DN76 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
U2AF1L5P0DN76 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
U2AF1L5P0DN76 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
U2AF1L5P0DN76 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
U2AF1L5P0DN76 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
U2AF1L5P0DN76 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
U2AF1L5P0DN76 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
U2AF1L5P0DN76 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
U2AF1L5P0DN76 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
U2AF1L5P0DN76 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
U2AF1L5P0DN76 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
U2AF1L5P0DN76 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
U2AF1L5P0DN76 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC21.29■■□□□ 1
U2AF1L5P0DN76 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
U2AF1L5P0DN76 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
U2AF1L5P0DN76 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC21.29■■□□□ 1
U2AF1L5P0DN76 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
U2AF1L5P0DN76 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
U2AF1L5P0DN76 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
U2AF1L5P0DN76 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
U2AF1L5P0DN76 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
U2AF1L5P0DN76 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
U2AF1L5P0DN76 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
U2AF1L5P0DN76 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
U2AF1L5P0DN76 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
U2AF1L5P0DN76 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
U2AF1L5P0DN76 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
U2AF1L5P0DN76 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
U2AF1L5P0DN76 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
U2AF1L5P0DN76 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
U2AF1L5P0DN76 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
U2AF1L5P0DN76 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
U2AF1L5P0DN76 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
U2AF1L5P0DN76 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
U2AF1L5P0DN76 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
U2AF1L5P0DN76 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
U2AF1L5P0DN76 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC21.28■■□□□ 1
U2AF1L5P0DN76 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
U2AF1L5P0DN76 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
U2AF1L5P0DN76 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
U2AF1L5P0DN76 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
U2AF1L5P0DN76 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
U2AF1L5P0DN76 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
U2AF1L5P0DN76 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
U2AF1L5P0DN76 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
U2AF1L5P0DN76 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
U2AF1L5P0DN76 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC21.28■■□□□ 1
U2AF1L5P0DN76 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
U2AF1L5P0DN76 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC21.28■■□□□ 1
U2AF1L5P0DN76 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
U2AF1L5P0DN76 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
U2AF1L5P0DN76 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
U2AF1L5P0DN76 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
U2AF1L5P0DN76 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
U2AF1L5P0DN76 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
U2AF1L5P0DN76 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
U2AF1L5P0DN76 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
U2AF1L5P0DN76 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
U2AF1L5P0DN76 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
U2AF1L5P0DN76 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
U2AF1L5P0DN76 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
U2AF1L5P0DN76 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
U2AF1L5P0DN76 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
U2AF1L5P0DN76 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
U2AF1L5P0DN76 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
U2AF1L5P0DN76 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
U2AF1L5P0DN76 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
U2AF1L5P0DN76 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
U2AF1L5P0DN76 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC21.27■■□□□ 1
U2AF1L5P0DN76 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
U2AF1L5P0DN76 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms