Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYBBP04839 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYBBP04839 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYBBP04839 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYBBP04839 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CYBBP04839 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYBBP04839 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CYBBP04839 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYBBP04839 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYBBP04839 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYBBP04839 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYBBP04839 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYBBP04839 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYBBP04839 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CYBBP04839 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYBBP04839 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYBBP04839 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CYBBP04839 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYBBP04839 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYBBP04839 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYBBP04839 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYBBP04839 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYBBP04839 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYBBP04839 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYBBP04839 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYBBP04839 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYBBP04839 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYBBP04839 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYBBP04839 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYBBP04839 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYBBP04839 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CYBBP04839 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYBBP04839 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CYBBP04839 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYBBP04839 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYBBP04839 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYBBP04839 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYBBP04839 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYBBP04839 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYBBP04839 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYBBP04839 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYBBP04839 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYBBP04839 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYBBP04839 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYBBP04839 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYBBP04839 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYBBP04839 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYBBP04839 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYBBP04839 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYBBP04839 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYBBP04839 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYBBP04839 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYBBP04839 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CYBBP04839 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYBBP04839 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYBBP04839 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYBBP04839 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYBBP04839 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CYBBP04839 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYBBP04839 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYBBP04839 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYBBP04839 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYBBP04839 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYBBP04839 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYBBP04839 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYBBP04839 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYBBP04839 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYBBP04839 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYBBP04839 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYBBP04839 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYBBP04839 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYBBP04839 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYBBP04839 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CYBBP04839 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYBBP04839 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYBBP04839 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYBBP04839 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CYBBP04839 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYBBP04839 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYBBP04839 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYBBP04839 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYBBP04839 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYBBP04839 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYBBP04839 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYBBP04839 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYBBP04839 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYBBP04839 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYBBP04839 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYBBP04839 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYBBP04839 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYBBP04839 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYBBP04839 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYBBP04839 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYBBP04839 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYBBP04839 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYBBP04839 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYBBP04839 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CYBBP04839 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CYBBP04839 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CYBBP04839 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms