Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
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