Protein–RNA interactions for Protein: B4DGG1

cDNA FLJ60496, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DGG1 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DGG1 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DGG1 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DGG1 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DGG1 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DGG1 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DGG1 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DGG1 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DGG1 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DGG1 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DGG1 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DGG1 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DGG1 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DGG1 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DGG1 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DGG1 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DGG1 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DGG1 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4DGG1 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4DGG1 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4DGG1 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4DGG1 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4DGG1 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4DGG1 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4DGG1 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4DGG1 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4DGG1 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4DGG1 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4DGG1 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4DGG1 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4DGG1 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4DGG1 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4DGG1 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4DGG1 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
B4DGG1 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
B4DGG1 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4DGG1 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4DGG1 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4DGG1 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4DGG1 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4DGG1 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4DGG1 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4DGG1 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
B4DGG1 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4DGG1 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4DGG1 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4DGG1 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4DGG1 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4DGG1 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
B4DGG1 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4DGG1 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4DGG1 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4DGG1 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4DGG1 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4DGG1 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4DGG1 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4DGG1 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4DGG1 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4DGG1 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4DGG1 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4DGG1 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4DGG1 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4DGG1 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4DGG1 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4DGG1 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4DGG1 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4DGG1 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4DGG1 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4DGG1 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4DGG1 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4DGG1 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4DGG1 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4DGG1 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4DGG1 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4DGG1 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4DGG1 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4DGG1 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4DGG1 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4DGG1 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4DGG1 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
B4DGG1 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4DGG1 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4DGG1 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4DGG1 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4DGG1 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4DGG1 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
B4DGG1 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4DGG1 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4DGG1 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4DGG1 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4DGG1 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4DGG1 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4DGG1 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4DGG1 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4DGG1 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4DGG1 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4DGG1 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4DGG1 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4DGG1 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4DGG1 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms