Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX8Q9Y5X2 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms