Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Y8

PRG3, Proteoglycan 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG3Q9Y2Y8 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRG3Q9Y2Y8 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRG3Q9Y2Y8 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRG3Q9Y2Y8 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRG3Q9Y2Y8 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRG3Q9Y2Y8 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRG3Q9Y2Y8 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRG3Q9Y2Y8 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRG3Q9Y2Y8 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRG3Q9Y2Y8 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRG3Q9Y2Y8 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRG3Q9Y2Y8 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRG3Q9Y2Y8 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRG3Q9Y2Y8 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRG3Q9Y2Y8 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRG3Q9Y2Y8 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRG3Q9Y2Y8 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRG3Q9Y2Y8 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRG3Q9Y2Y8 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRG3Q9Y2Y8 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRG3Q9Y2Y8 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRG3Q9Y2Y8 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRG3Q9Y2Y8 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRG3Q9Y2Y8 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRG3Q9Y2Y8 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRG3Q9Y2Y8 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRG3Q9Y2Y8 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRG3Q9Y2Y8 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRG3Q9Y2Y8 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRG3Q9Y2Y8 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRG3Q9Y2Y8 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRG3Q9Y2Y8 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRG3Q9Y2Y8 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRG3Q9Y2Y8 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRG3Q9Y2Y8 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRG3Q9Y2Y8 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRG3Q9Y2Y8 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRG3Q9Y2Y8 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRG3Q9Y2Y8 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRG3Q9Y2Y8 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRG3Q9Y2Y8 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRG3Q9Y2Y8 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRG3Q9Y2Y8 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRG3Q9Y2Y8 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRG3Q9Y2Y8 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRG3Q9Y2Y8 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRG3Q9Y2Y8 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRG3Q9Y2Y8 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRG3Q9Y2Y8 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRG3Q9Y2Y8 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRG3Q9Y2Y8 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRG3Q9Y2Y8 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRG3Q9Y2Y8 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRG3Q9Y2Y8 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRG3Q9Y2Y8 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRG3Q9Y2Y8 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRG3Q9Y2Y8 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PRG3Q9Y2Y8 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRG3Q9Y2Y8 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRG3Q9Y2Y8 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRG3Q9Y2Y8 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRG3Q9Y2Y8 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRG3Q9Y2Y8 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRG3Q9Y2Y8 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRG3Q9Y2Y8 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRG3Q9Y2Y8 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRG3Q9Y2Y8 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRG3Q9Y2Y8 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRG3Q9Y2Y8 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRG3Q9Y2Y8 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRG3Q9Y2Y8 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRG3Q9Y2Y8 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRG3Q9Y2Y8 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRG3Q9Y2Y8 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRG3Q9Y2Y8 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRG3Q9Y2Y8 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRG3Q9Y2Y8 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRG3Q9Y2Y8 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRG3Q9Y2Y8 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRG3Q9Y2Y8 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PRG3Q9Y2Y8 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRG3Q9Y2Y8 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRG3Q9Y2Y8 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRG3Q9Y2Y8 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRG3Q9Y2Y8 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRG3Q9Y2Y8 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRG3Q9Y2Y8 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRG3Q9Y2Y8 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRG3Q9Y2Y8 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PRG3Q9Y2Y8 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRG3Q9Y2Y8 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRG3Q9Y2Y8 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRG3Q9Y2Y8 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRG3Q9Y2Y8 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRG3Q9Y2Y8 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRG3Q9Y2Y8 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRG3Q9Y2Y8 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRG3Q9Y2Y8 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PRG3Q9Y2Y8 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRG3Q9Y2Y8 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms