Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAPPC8Q9Y2L5 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAPPC8Q9Y2L5 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAPPC8Q9Y2L5 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAPPC8Q9Y2L5 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAPPC8Q9Y2L5 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAPPC8Q9Y2L5 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAPPC8Q9Y2L5 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAPPC8Q9Y2L5 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAPPC8Q9Y2L5 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAPPC8Q9Y2L5 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAPPC8Q9Y2L5 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAPPC8Q9Y2L5 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAPPC8Q9Y2L5 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRAPPC8Q9Y2L5 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRAPPC8Q9Y2L5 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
TRAPPC8Q9Y2L5 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRAPPC8Q9Y2L5 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRAPPC8Q9Y2L5 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRAPPC8Q9Y2L5 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRAPPC8Q9Y2L5 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRAPPC8Q9Y2L5 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRAPPC8Q9Y2L5 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRAPPC8Q9Y2L5 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRAPPC8Q9Y2L5 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRAPPC8Q9Y2L5 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRAPPC8Q9Y2L5 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRAPPC8Q9Y2L5 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRAPPC8Q9Y2L5 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRAPPC8Q9Y2L5 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRAPPC8Q9Y2L5 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRAPPC8Q9Y2L5 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRAPPC8Q9Y2L5 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAPPC8Q9Y2L5 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAPPC8Q9Y2L5 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAPPC8Q9Y2L5 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAPPC8Q9Y2L5 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAPPC8Q9Y2L5 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAPPC8Q9Y2L5 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAPPC8Q9Y2L5 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAPPC8Q9Y2L5 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAPPC8Q9Y2L5 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAPPC8Q9Y2L5 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAPPC8Q9Y2L5 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAPPC8Q9Y2L5 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAPPC8Q9Y2L5 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAPPC8Q9Y2L5 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAPPC8Q9Y2L5 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAPPC8Q9Y2L5 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAPPC8Q9Y2L5 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAPPC8Q9Y2L5 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAPPC8Q9Y2L5 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAPPC8Q9Y2L5 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAPPC8Q9Y2L5 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAPPC8Q9Y2L5 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAPPC8Q9Y2L5 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAPPC8Q9Y2L5 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAPPC8Q9Y2L5 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAPPC8Q9Y2L5 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAPPC8Q9Y2L5 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAPPC8Q9Y2L5 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAPPC8Q9Y2L5 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAPPC8Q9Y2L5 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAPPC8Q9Y2L5 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAPPC8Q9Y2L5 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAPPC8Q9Y2L5 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAPPC8Q9Y2L5 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAPPC8Q9Y2L5 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAPPC8Q9Y2L5 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAPPC8Q9Y2L5 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAPPC8Q9Y2L5 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAPPC8Q9Y2L5 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAPPC8Q9Y2L5 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAPPC8Q9Y2L5 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAPPC8Q9Y2L5 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAPPC8Q9Y2L5 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAPPC8Q9Y2L5 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAPPC8Q9Y2L5 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAPPC8Q9Y2L5 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAPPC8Q9Y2L5 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAPPC8Q9Y2L5 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAPPC8Q9Y2L5 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAPPC8Q9Y2L5 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAPPC8Q9Y2L5 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAPPC8Q9Y2L5 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAPPC8Q9Y2L5 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAPPC8Q9Y2L5 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms