Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHPF2Q9P2E5 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CHPF2Q9P2E5 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CHPF2Q9P2E5 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CHPF2Q9P2E5 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHPF2Q9P2E5 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHPF2Q9P2E5 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHPF2Q9P2E5 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHPF2Q9P2E5 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHPF2Q9P2E5 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHPF2Q9P2E5 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHPF2Q9P2E5 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHPF2Q9P2E5 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHPF2Q9P2E5 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHPF2Q9P2E5 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHPF2Q9P2E5 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHPF2Q9P2E5 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHPF2Q9P2E5 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CHPF2Q9P2E5 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CHPF2Q9P2E5 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHPF2Q9P2E5 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms