Protein–RNA interactions for Protein: Q96S42

NODAL, Nodal homolog, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NODALQ96S42 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NODALQ96S42 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NODALQ96S42 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NODALQ96S42 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NODALQ96S42 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NODALQ96S42 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NODALQ96S42 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NODALQ96S42 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NODALQ96S42 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NODALQ96S42 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NODALQ96S42 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NODALQ96S42 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NODALQ96S42 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NODALQ96S42 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NODALQ96S42 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NODALQ96S42 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NODALQ96S42 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NODALQ96S42 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NODALQ96S42 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NODALQ96S42 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NODALQ96S42 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NODALQ96S42 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NODALQ96S42 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NODALQ96S42 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NODALQ96S42 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NODALQ96S42 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NODALQ96S42 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NODALQ96S42 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NODALQ96S42 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NODALQ96S42 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NODALQ96S42 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NODALQ96S42 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NODALQ96S42 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NODALQ96S42 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NODALQ96S42 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NODALQ96S42 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NODALQ96S42 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NODALQ96S42 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NODALQ96S42 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NODALQ96S42 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NODALQ96S42 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NODALQ96S42 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NODALQ96S42 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NODALQ96S42 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NODALQ96S42 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NODALQ96S42 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NODALQ96S42 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NODALQ96S42 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NODALQ96S42 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NODALQ96S42 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NODALQ96S42 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NODALQ96S42 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NODALQ96S42 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NODALQ96S42 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NODALQ96S42 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NODALQ96S42 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NODALQ96S42 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NODALQ96S42 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NODALQ96S42 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NODALQ96S42 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NODALQ96S42 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NODALQ96S42 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NODALQ96S42 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NODALQ96S42 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NODALQ96S42 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NODALQ96S42 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NODALQ96S42 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NODALQ96S42 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NODALQ96S42 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NODALQ96S42 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NODALQ96S42 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NODALQ96S42 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NODALQ96S42 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NODALQ96S42 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NODALQ96S42 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NODALQ96S42 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NODALQ96S42 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NODALQ96S42 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NODALQ96S42 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NODALQ96S42 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NODALQ96S42 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NODALQ96S42 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NODALQ96S42 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NODALQ96S42 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NODALQ96S42 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NODALQ96S42 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NODALQ96S42 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NODALQ96S42 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NODALQ96S42 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NODALQ96S42 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NODALQ96S42 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NODALQ96S42 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NODALQ96S42 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NODALQ96S42 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NODALQ96S42 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NODALQ96S42 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NODALQ96S42 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NODALQ96S42 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NODALQ96S42 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NODALQ96S42 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms