Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC21.31■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC21.3■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC21.29■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC21.29■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC21.29■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC21.28■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC21.28■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC21.28■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC21.28■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LTV1Q96GA3 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms