Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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CLDN19Q8N6F1 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN19Q8N6F1 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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