Protein–RNA interactions for Protein: Q2I0M5

RSPO4, R-spondin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPO4Q2I0M5 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RSPO4Q2I0M5 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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