Protein–RNA interactions for Protein: Q16563

SYPL1, Synaptophysin-like protein 1, humanhuman

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Length 259 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL1Q16563 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SYPL1Q16563 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SYPL1Q16563 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SYPL1Q16563 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SYPL1Q16563 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SYPL1Q16563 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SYPL1Q16563 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SYPL1Q16563 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
SYPL1Q16563 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SYPL1Q16563 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SYPL1Q16563 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SYPL1Q16563 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
SYPL1Q16563 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SYPL1Q16563 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SYPL1Q16563 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SYPL1Q16563 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SYPL1Q16563 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SYPL1Q16563 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
SYPL1Q16563 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SYPL1Q16563 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
SYPL1Q16563 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SYPL1Q16563 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SYPL1Q16563 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SYPL1Q16563 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SYPL1Q16563 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SYPL1Q16563 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SYPL1Q16563 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SYPL1Q16563 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SYPL1Q16563 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SYPL1Q16563 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SYPL1Q16563 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SYPL1Q16563 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SYPL1Q16563 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SYPL1Q16563 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SYPL1Q16563 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SYPL1Q16563 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SYPL1Q16563 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SYPL1Q16563 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SYPL1Q16563 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SYPL1Q16563 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SYPL1Q16563 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SYPL1Q16563 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SYPL1Q16563 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SYPL1Q16563 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SYPL1Q16563 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SYPL1Q16563 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SYPL1Q16563 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
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SYPL1Q16563 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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SYPL1Q16563 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SYPL1Q16563 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SYPL1Q16563 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SYPL1Q16563 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SYPL1Q16563 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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SYPL1Q16563 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SYPL1Q16563 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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SYPL1Q16563 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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SYPL1Q16563 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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SYPL1Q16563 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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SYPL1Q16563 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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SYPL1Q16563 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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