Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 APOBEC3H-202ENST00000401756 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 RN7SL602P-201ENST00000578326 324 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTGDRQ13258 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTGDRQ13258 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTGDRQ13258 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTGDRQ13258 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTGDRQ13258 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTGDRQ13258 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTGDRQ13258 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTGDRQ13258 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
PTGDRQ13258 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTGDRQ13258 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTGDRQ13258 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTGDRQ13258 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTGDRQ13258 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTGDRQ13258 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTGDRQ13258 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTGDRQ13258 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTGDRQ13258 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTGDRQ13258 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTGDRQ13258 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTGDRQ13258 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTGDRQ13258 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTGDRQ13258 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms