Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms