Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVPABLB-1P60509 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms