Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CASP9P55211 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CASP9P55211 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CASP9P55211 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CASP9P55211 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CASP9P55211 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CASP9P55211 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CASP9P55211 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CASP9P55211 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CASP9P55211 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CASP9P55211 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CASP9P55211 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CASP9P55211 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CASP9P55211 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CASP9P55211 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CASP9P55211 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CASP9P55211 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CASP9P55211 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CASP9P55211 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CASP9P55211 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CASP9P55211 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CASP9P55211 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CASP9P55211 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CASP9P55211 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CASP9P55211 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CASP9P55211 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CASP9P55211 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CASP9P55211 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CASP9P55211 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CASP9P55211 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CASP9P55211 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CASP9P55211 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CASP9P55211 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CASP9P55211 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CASP9P55211 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CASP9P55211 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CASP9P55211 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CASP9P55211 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CASP9P55211 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CASP9P55211 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CASP9P55211 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CASP9P55211 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CASP9P55211 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CASP9P55211 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CASP9P55211 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CASP9P55211 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CASP9P55211 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CASP9P55211 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CASP9P55211 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CASP9P55211 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CASP9P55211 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CASP9P55211 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CASP9P55211 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CASP9P55211 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CASP9P55211 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CASP9P55211 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CASP9P55211 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CASP9P55211 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CASP9P55211 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CASP9P55211 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CASP9P55211 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CASP9P55211 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CASP9P55211 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CASP9P55211 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CASP9P55211 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CASP9P55211 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CASP9P55211 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CASP9P55211 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CASP9P55211 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CASP9P55211 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CASP9P55211 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CASP9P55211 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CASP9P55211 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CASP9P55211 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CASP9P55211 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CASP9P55211 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CASP9P55211 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CASP9P55211 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CASP9P55211 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CASP9P55211 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CASP9P55211 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CASP9P55211 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CASP9P55211 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CASP9P55211 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CASP9P55211 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CASP9P55211 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CASP9P55211 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CASP9P55211 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CASP9P55211 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CASP9P55211 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CASP9P55211 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CASP9P55211 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CASP9P55211 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CASP9P55211 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CASP9P55211 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CASP9P55211 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CASP9P55211 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CASP9P55211 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CASP9P55211 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CASP9P55211 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms