Protein–RNA interactions for Protein: P39086

GRIK1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK1P39086 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
GRIK1P39086 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
GRIK1P39086 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
GRIK1P39086 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
GRIK1P39086 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GRIK1P39086 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GRIK1P39086 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GRIK1P39086 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GRIK1P39086 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GRIK1P39086 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GRIK1P39086 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GRIK1P39086 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GRIK1P39086 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GRIK1P39086 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GRIK1P39086 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GRIK1P39086 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GRIK1P39086 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GRIK1P39086 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GRIK1P39086 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GRIK1P39086 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GRIK1P39086 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GRIK1P39086 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GRIK1P39086 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GRIK1P39086 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms