Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CPS1P31327 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CPS1P31327 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPS1P31327 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPS1P31327 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPS1P31327 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPS1P31327 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPS1P31327 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPS1P31327 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPS1P31327 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPS1P31327 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPS1P31327 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CPS1P31327 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPS1P31327 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPS1P31327 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CPS1P31327 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPS1P31327 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPS1P31327 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPS1P31327 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPS1P31327 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPS1P31327 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPS1P31327 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPS1P31327 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPS1P31327 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPS1P31327 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPS1P31327 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPS1P31327 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPS1P31327 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPS1P31327 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPS1P31327 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPS1P31327 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPS1P31327 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPS1P31327 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPS1P31327 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPS1P31327 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPS1P31327 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CPS1P31327 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CPS1P31327 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CPS1P31327 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CPS1P31327 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CPS1P31327 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CPS1P31327 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CPS1P31327 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CPS1P31327 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CPS1P31327 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CPS1P31327 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CPS1P31327 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CPS1P31327 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CPS1P31327 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CPS1P31327 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CPS1P31327 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CPS1P31327 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CPS1P31327 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CPS1P31327 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CPS1P31327 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CPS1P31327 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CPS1P31327 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CPS1P31327 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CPS1P31327 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CPS1P31327 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CPS1P31327 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CPS1P31327 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CPS1P31327 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CPS1P31327 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CPS1P31327 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CPS1P31327 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CPS1P31327 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CPS1P31327 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CPS1P31327 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CPS1P31327 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CPS1P31327 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CPS1P31327 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CPS1P31327 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CPS1P31327 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CPS1P31327 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CPS1P31327 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CPS1P31327 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CPS1P31327 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CPS1P31327 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CPS1P31327 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CPS1P31327 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CPS1P31327 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CPS1P31327 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CPS1P31327 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CPS1P31327 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CPS1P31327 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CPS1P31327 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CPS1P31327 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CPS1P31327 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CPS1P31327 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CPS1P31327 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CPS1P31327 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CPS1P31327 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CPS1P31327 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CPS1P31327 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CPS1P31327 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CPS1P31327 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CPS1P31327 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CPS1P31327 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CPS1P31327 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms