Protein–RNA interactions for Protein: P22415

USF1, Upstream stimulatory factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF1P22415 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
USF1P22415 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
USF1P22415 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
USF1P22415 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
USF1P22415 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
USF1P22415 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
USF1P22415 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
USF1P22415 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
USF1P22415 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
USF1P22415 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
USF1P22415 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
USF1P22415 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
USF1P22415 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
USF1P22415 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
USF1P22415 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
USF1P22415 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
USF1P22415 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
USF1P22415 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
USF1P22415 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
USF1P22415 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
USF1P22415 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
USF1P22415 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
USF1P22415 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
USF1P22415 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
USF1P22415 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
USF1P22415 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
USF1P22415 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
USF1P22415 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
USF1P22415 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
USF1P22415 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
USF1P22415 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
USF1P22415 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
USF1P22415 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
USF1P22415 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
USF1P22415 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
USF1P22415 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
USF1P22415 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
USF1P22415 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
USF1P22415 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
USF1P22415 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
USF1P22415 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
USF1P22415 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
USF1P22415 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
USF1P22415 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
USF1P22415 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
USF1P22415 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
USF1P22415 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
USF1P22415 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
USF1P22415 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
USF1P22415 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
USF1P22415 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
USF1P22415 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
USF1P22415 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
USF1P22415 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
USF1P22415 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
USF1P22415 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
USF1P22415 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
USF1P22415 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
USF1P22415 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
USF1P22415 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
USF1P22415 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
USF1P22415 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
USF1P22415 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
USF1P22415 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
USF1P22415 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
USF1P22415 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
USF1P22415 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
USF1P22415 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
USF1P22415 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
USF1P22415 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
USF1P22415 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
USF1P22415 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
USF1P22415 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
USF1P22415 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
USF1P22415 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
USF1P22415 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
USF1P22415 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
USF1P22415 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
USF1P22415 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
USF1P22415 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
USF1P22415 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
USF1P22415 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
USF1P22415 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
USF1P22415 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
USF1P22415 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
USF1P22415 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
USF1P22415 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
USF1P22415 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
USF1P22415 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
USF1P22415 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
USF1P22415 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
USF1P22415 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
USF1P22415 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
USF1P22415 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
USF1P22415 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
USF1P22415 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
USF1P22415 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
USF1P22415 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
USF1P22415 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
USF1P22415 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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