Protein–RNA interactions for Protein: P0CW18

PRSS56, Serine protease 56, humanhuman

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRSS56P0CW18 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRSS56P0CW18 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRSS56P0CW18 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRSS56P0CW18 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRSS56P0CW18 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRSS56P0CW18 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRSS56P0CW18 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRSS56P0CW18 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRSS56P0CW18 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRSS56P0CW18 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRSS56P0CW18 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRSS56P0CW18 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRSS56P0CW18 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRSS56P0CW18 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRSS56P0CW18 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PRSS56P0CW18 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRSS56P0CW18 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRSS56P0CW18 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRSS56P0CW18 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRSS56P0CW18 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRSS56P0CW18 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRSS56P0CW18 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRSS56P0CW18 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRSS56P0CW18 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRSS56P0CW18 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRSS56P0CW18 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRSS56P0CW18 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRSS56P0CW18 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRSS56P0CW18 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRSS56P0CW18 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRSS56P0CW18 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PRSS56P0CW18 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRSS56P0CW18 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRSS56P0CW18 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRSS56P0CW18 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRSS56P0CW18 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRSS56P0CW18 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRSS56P0CW18 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRSS56P0CW18 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRSS56P0CW18 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRSS56P0CW18 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRSS56P0CW18 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRSS56P0CW18 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRSS56P0CW18 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRSS56P0CW18 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRSS56P0CW18 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRSS56P0CW18 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRSS56P0CW18 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRSS56P0CW18 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRSS56P0CW18 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRSS56P0CW18 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRSS56P0CW18 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRSS56P0CW18 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRSS56P0CW18 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRSS56P0CW18 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRSS56P0CW18 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRSS56P0CW18 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PRSS56P0CW18 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRSS56P0CW18 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRSS56P0CW18 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRSS56P0CW18 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRSS56P0CW18 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRSS56P0CW18 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRSS56P0CW18 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRSS56P0CW18 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRSS56P0CW18 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRSS56P0CW18 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRSS56P0CW18 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRSS56P0CW18 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PRSS56P0CW18 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRSS56P0CW18 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRSS56P0CW18 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRSS56P0CW18 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRSS56P0CW18 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PRSS56P0CW18 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRSS56P0CW18 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRSS56P0CW18 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRSS56P0CW18 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRSS56P0CW18 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PRSS56P0CW18 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRSS56P0CW18 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRSS56P0CW18 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRSS56P0CW18 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRSS56P0CW18 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRSS56P0CW18 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRSS56P0CW18 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRSS56P0CW18 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PRSS56P0CW18 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRSS56P0CW18 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRSS56P0CW18 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRSS56P0CW18 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRSS56P0CW18 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRSS56P0CW18 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRSS56P0CW18 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRSS56P0CW18 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRSS56P0CW18 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRSS56P0CW18 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRSS56P0CW18 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRSS56P0CW18 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRSS56P0CW18 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms