Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPLO60437 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPLO60437 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPLO60437 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPLO60437 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPLO60437 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPLO60437 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPLO60437 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPLO60437 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPLO60437 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPLO60437 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPLO60437 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPLO60437 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPLO60437 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPLO60437 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPLO60437 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPLO60437 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPLO60437 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPLO60437 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPLO60437 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPLO60437 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PPLO60437 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPLO60437 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPLO60437 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPLO60437 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PPLO60437 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PPLO60437 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PPLO60437 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPLO60437 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPLO60437 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPLO60437 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPLO60437 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPLO60437 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPLO60437 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPLO60437 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPLO60437 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPLO60437 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPLO60437 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPLO60437 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPLO60437 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPLO60437 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPLO60437 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPLO60437 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPLO60437 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPLO60437 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPLO60437 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPLO60437 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPLO60437 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPLO60437 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PPLO60437 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPLO60437 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPLO60437 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPLO60437 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPLO60437 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPLO60437 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPLO60437 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPLO60437 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPLO60437 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPLO60437 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPLO60437 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPLO60437 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPLO60437 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPLO60437 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPLO60437 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPLO60437 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPLO60437 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPLO60437 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPLO60437 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPLO60437 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PPLO60437 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPLO60437 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPLO60437 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPLO60437 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPLO60437 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPLO60437 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPLO60437 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPLO60437 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPLO60437 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPLO60437 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPLO60437 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPLO60437 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPLO60437 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPLO60437 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PPLO60437 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPLO60437 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPLO60437 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPLO60437 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PPLO60437 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PPLO60437 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPLO60437 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPLO60437 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPLO60437 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPLO60437 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPLO60437 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPLO60437 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPLO60437 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPLO60437 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPLO60437 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPLO60437 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPLO60437 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms