Protein–RNA interactions for Protein: A2RUR9

CCDC144A, Coiled-coil domain-containing protein 144A, humanhuman

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144AA2RUR9 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC144AA2RUR9 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC144AA2RUR9 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC144AA2RUR9 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC144AA2RUR9 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC144AA2RUR9 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC144AA2RUR9 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC144AA2RUR9 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC144AA2RUR9 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC144AA2RUR9 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC144AA2RUR9 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC144AA2RUR9 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC144AA2RUR9 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC144AA2RUR9 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC144AA2RUR9 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC144AA2RUR9 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC144AA2RUR9 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC144AA2RUR9 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC144AA2RUR9 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC144AA2RUR9 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC144AA2RUR9 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC144AA2RUR9 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC144AA2RUR9 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC144AA2RUR9 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC144AA2RUR9 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC144AA2RUR9 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC144AA2RUR9 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC144AA2RUR9 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC144AA2RUR9 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC144AA2RUR9 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC144AA2RUR9 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC144AA2RUR9 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC144AA2RUR9 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC144AA2RUR9 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC144AA2RUR9 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC144AA2RUR9 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC144AA2RUR9 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC144AA2RUR9 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC144AA2RUR9 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC144AA2RUR9 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC144AA2RUR9 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC144AA2RUR9 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC144AA2RUR9 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC144AA2RUR9 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC144AA2RUR9 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC144AA2RUR9 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC144AA2RUR9 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC144AA2RUR9 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC144AA2RUR9 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC144AA2RUR9 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC144AA2RUR9 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC144AA2RUR9 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC144AA2RUR9 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC144AA2RUR9 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC144AA2RUR9 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC144AA2RUR9 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC144AA2RUR9 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC144AA2RUR9 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC144AA2RUR9 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC144AA2RUR9 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC144AA2RUR9 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC144AA2RUR9 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC144AA2RUR9 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC144AA2RUR9 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC144AA2RUR9 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC144AA2RUR9 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC144AA2RUR9 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC144AA2RUR9 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC144AA2RUR9 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC144AA2RUR9 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC144AA2RUR9 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC144AA2RUR9 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC144AA2RUR9 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC144AA2RUR9 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC144AA2RUR9 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC144AA2RUR9 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC144AA2RUR9 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC144AA2RUR9 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC144AA2RUR9 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC144AA2RUR9 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC144AA2RUR9 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC144AA2RUR9 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC144AA2RUR9 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC144AA2RUR9 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC144AA2RUR9 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC144AA2RUR9 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC144AA2RUR9 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC144AA2RUR9 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC144AA2RUR9 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC144AA2RUR9 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC144AA2RUR9 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC144AA2RUR9 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC144AA2RUR9 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC144AA2RUR9 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC144AA2RUR9 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC144AA2RUR9 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC144AA2RUR9 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC144AA2RUR9 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC144AA2RUR9 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC144AA2RUR9 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms