Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC21.3■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC21.29■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC21.29■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms