Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM8Q9BZR9 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TRIM8Q9BZR9 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TRIM8Q9BZR9 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM8Q9BZR9 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM8Q9BZR9 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM8Q9BZR9 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM8Q9BZR9 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM8Q9BZR9 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM8Q9BZR9 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM8Q9BZR9 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM8Q9BZR9 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM8Q9BZR9 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM8Q9BZR9 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM8Q9BZR9 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM8Q9BZR9 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM8Q9BZR9 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM8Q9BZR9 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM8Q9BZR9 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM8Q9BZR9 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM8Q9BZR9 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM8Q9BZR9 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM8Q9BZR9 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM8Q9BZR9 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM8Q9BZR9 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM8Q9BZR9 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM8Q9BZR9 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM8Q9BZR9 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM8Q9BZR9 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM8Q9BZR9 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM8Q9BZR9 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM8Q9BZR9 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM8Q9BZR9 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM8Q9BZR9 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM8Q9BZR9 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM8Q9BZR9 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM8Q9BZR9 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM8Q9BZR9 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM8Q9BZR9 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM8Q9BZR9 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM8Q9BZR9 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM8Q9BZR9 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM8Q9BZR9 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM8Q9BZR9 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM8Q9BZR9 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM8Q9BZR9 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM8Q9BZR9 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM8Q9BZR9 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRIM8Q9BZR9 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRIM8Q9BZR9 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRIM8Q9BZR9 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRIM8Q9BZR9 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms