Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
HERPUD2Q9BSE4 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
HERPUD2Q9BSE4 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERPUD2Q9BSE4 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERPUD2Q9BSE4 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERPUD2Q9BSE4 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERPUD2Q9BSE4 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERPUD2Q9BSE4 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERPUD2Q9BSE4 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERPUD2Q9BSE4 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERPUD2Q9BSE4 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERPUD2Q9BSE4 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERPUD2Q9BSE4 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERPUD2Q9BSE4 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERPUD2Q9BSE4 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERPUD2Q9BSE4 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HERPUD2Q9BSE4 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERPUD2Q9BSE4 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERPUD2Q9BSE4 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERPUD2Q9BSE4 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HERPUD2Q9BSE4 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HERPUD2Q9BSE4 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HERPUD2Q9BSE4 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERPUD2Q9BSE4 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERPUD2Q9BSE4 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERPUD2Q9BSE4 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERPUD2Q9BSE4 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERPUD2Q9BSE4 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERPUD2Q9BSE4 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HERPUD2Q9BSE4 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HERPUD2Q9BSE4 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERPUD2Q9BSE4 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HERPUD2Q9BSE4 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HERPUD2Q9BSE4 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERPUD2Q9BSE4 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms