Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 MGA-212ENST00000619521 1496 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 SULT1A1-211ENST00000569554 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 AC066613.1-202ENST00000560727 630 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SGIP1Q9BQI5 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80 ms