Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 AC011700.1-201ENST00000610409 2627 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 MVP-202ENST00000395353 2925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 PLSCR4-203ENST00000433593 2839 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 GNAL-203ENST00000423027 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SPOCK3Q9BQ16 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SPOCK3Q9BQ16 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SPOCK3Q9BQ16 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SPOCK3Q9BQ16 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
SPOCK3Q9BQ16 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SPOCK3Q9BQ16 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
SPOCK3Q9BQ16 STK33P1-201ENST00000423835 1218 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
SPOCK3Q9BQ16 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SPOCK3Q9BQ16 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SPOCK3Q9BQ16 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SPOCK3Q9BQ16 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SPOCK3Q9BQ16 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SPOCK3Q9BQ16 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms