Protein–RNA interactions for Protein: Q96CM4

NXNL1, Nucleoredoxin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXNL1Q96CM4 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NXNL1Q96CM4 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms