Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT06

CEP350, Centrosome-associated protein 350, humanhuman

Predictions only

Length 3,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP350Q5VT06 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 CADM1-221ENST00000612235 1042 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CEP350Q5VT06 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CEP350Q5VT06 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CEP350Q5VT06 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CEP350Q5VT06 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CEP350Q5VT06 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CEP350Q5VT06 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CEP350Q5VT06 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CEP350Q5VT06 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CEP350Q5VT06 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
CEP350Q5VT06 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CEP350Q5VT06 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CEP350Q5VT06 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CEP350Q5VT06 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CEP350Q5VT06 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CEP350Q5VT06 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CEP350Q5VT06 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CEP350Q5VT06 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CEP350Q5VT06 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CEP350Q5VT06 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CEP350Q5VT06 VCX3A-202ENST00000398729 808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CEP350Q5VT06 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CEP350Q5VT06 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CEP350Q5VT06 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CEP350Q5VT06 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CEP350Q5VT06 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CEP350Q5VT06 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CEP350Q5VT06 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CEP350Q5VT06 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CEP350Q5VT06 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CEP350Q5VT06 HIST1H2AE-201ENST00000303910 509 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CEP350Q5VT06 ATP5H-202ENST00000344546 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CEP350Q5VT06 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CEP350Q5VT06 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CEP350Q5VT06 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CEP350Q5VT06 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CEP350Q5VT06 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CEP350Q5VT06 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CEP350Q5VT06 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CEP350Q5VT06 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CEP350Q5VT06 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CEP350Q5VT06 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CEP350Q5VT06 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CEP350Q5VT06 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CEP350Q5VT06 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CEP350Q5VT06 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CEP350Q5VT06 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CEP350Q5VT06 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CEP350Q5VT06 SIGLEC20P-201ENST00000595243 1311 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CEP350Q5VT06 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CEP350Q5VT06 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CEP350Q5VT06 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CEP350Q5VT06 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CEP350Q5VT06 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CEP350Q5VT06 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CEP350Q5VT06 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CEP350Q5VT06 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CEP350Q5VT06 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CEP350Q5VT06 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CEP350Q5VT06 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CEP350Q5VT06 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CEP350Q5VT06 PHF5A-201ENST00000216252 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CEP350Q5VT06 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CEP350Q5VT06 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CEP350Q5VT06 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CEP350Q5VT06 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CEP350Q5VT06 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CEP350Q5VT06 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CEP350Q5VT06 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CEP350Q5VT06 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CEP350Q5VT06 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CEP350Q5VT06 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CEP350Q5VT06 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CEP350Q5VT06 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CEP350Q5VT06 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CEP350Q5VT06 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CEP350Q5VT06 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CEP350Q5VT06 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CEP350Q5VT06 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CEP350Q5VT06 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CEP350Q5VT06 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CEP350Q5VT06 APOPT1-215ENST00000556253 783 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CEP350Q5VT06 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CEP350Q5VT06 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CEP350Q5VT06 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CEP350Q5VT06 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CEP350Q5VT06 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CEP350Q5VT06 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CEP350Q5VT06 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CEP350Q5VT06 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CEP350Q5VT06 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CEP350Q5VT06 AC012213.1-201ENST00000517376 722 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CEP350Q5VT06 IQSEC2-207ENST00000638583 722 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CEP350Q5VT06 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CEP350Q5VT06 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CEP350Q5VT06 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms