Protein–RNA interactions for Protein: Q13610

PWP1, Periodic tryptophan protein 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PWP1Q13610 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PWP1Q13610 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PWP1Q13610 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PWP1Q13610 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PWP1Q13610 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PWP1Q13610 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PWP1Q13610 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PWP1Q13610 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PWP1Q13610 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PWP1Q13610 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PWP1Q13610 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PWP1Q13610 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PWP1Q13610 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PWP1Q13610 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PWP1Q13610 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PWP1Q13610 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PWP1Q13610 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PWP1Q13610 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PWP1Q13610 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PWP1Q13610 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PWP1Q13610 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PWP1Q13610 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PWP1Q13610 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PWP1Q13610 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PWP1Q13610 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PWP1Q13610 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PWP1Q13610 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PWP1Q13610 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PWP1Q13610 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PWP1Q13610 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PWP1Q13610 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PWP1Q13610 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PWP1Q13610 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PWP1Q13610 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PWP1Q13610 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PWP1Q13610 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PWP1Q13610 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PWP1Q13610 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PWP1Q13610 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PWP1Q13610 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PWP1Q13610 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PWP1Q13610 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PWP1Q13610 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PWP1Q13610 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PWP1Q13610 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PWP1Q13610 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PWP1Q13610 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PWP1Q13610 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PWP1Q13610 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PWP1Q13610 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PWP1Q13610 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PWP1Q13610 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PWP1Q13610 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PWP1Q13610 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PWP1Q13610 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PWP1Q13610 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PWP1Q13610 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PWP1Q13610 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PWP1Q13610 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PWP1Q13610 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PWP1Q13610 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PWP1Q13610 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PWP1Q13610 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PWP1Q13610 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PWP1Q13610 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PWP1Q13610 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PWP1Q13610 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PWP1Q13610 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PWP1Q13610 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PWP1Q13610 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PWP1Q13610 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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PWP1Q13610 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PWP1Q13610 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PWP1Q13610 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PWP1Q13610 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PWP1Q13610 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PWP1Q13610 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PWP1Q13610 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PWP1Q13610 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PWP1Q13610 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PWP1Q13610 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PWP1Q13610 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PWP1Q13610 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PWP1Q13610 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PWP1Q13610 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PWP1Q13610 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PWP1Q13610 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PWP1Q13610 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PWP1Q13610 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PWP1Q13610 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PWP1Q13610 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PWP1Q13610 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PWP1Q13610 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PWP1Q13610 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PWP1Q13610 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PWP1Q13610 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms