Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms