Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
CHAF1AQ13111 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms