Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
KCNMA1Q12791 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms