Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SSRP1Q08945 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms