Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NME5P56597 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NME5P56597 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NME5P56597 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NME5P56597 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NME5P56597 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NME5P56597 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NME5P56597 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NME5P56597 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NME5P56597 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NME5P56597 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NME5P56597 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NME5P56597 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NME5P56597 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NME5P56597 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NME5P56597 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NME5P56597 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NME5P56597 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NME5P56597 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NME5P56597 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NME5P56597 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NME5P56597 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NME5P56597 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NME5P56597 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NME5P56597 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NME5P56597 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NME5P56597 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NME5P56597 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NME5P56597 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NME5P56597 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NME5P56597 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NME5P56597 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NME5P56597 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NME5P56597 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NME5P56597 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NME5P56597 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NME5P56597 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NME5P56597 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NME5P56597 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NME5P56597 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NME5P56597 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NME5P56597 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NME5P56597 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NME5P56597 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NME5P56597 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NME5P56597 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NME5P56597 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NME5P56597 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NME5P56597 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NME5P56597 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NME5P56597 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NME5P56597 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NME5P56597 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NME5P56597 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NME5P56597 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NME5P56597 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NME5P56597 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NME5P56597 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NME5P56597 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NME5P56597 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NME5P56597 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NME5P56597 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NME5P56597 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NME5P56597 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NME5P56597 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NME5P56597 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NME5P56597 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NME5P56597 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NME5P56597 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NME5P56597 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NME5P56597 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NME5P56597 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NME5P56597 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NME5P56597 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NME5P56597 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NME5P56597 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NME5P56597 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NME5P56597 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NME5P56597 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NME5P56597 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NME5P56597 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NME5P56597 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NME5P56597 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NME5P56597 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NME5P56597 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NME5P56597 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NME5P56597 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NME5P56597 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NME5P56597 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NME5P56597 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NME5P56597 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NME5P56597 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NME5P56597 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NME5P56597 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NME5P56597 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NME5P56597 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NME5P56597 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NME5P56597 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NME5P56597 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NME5P56597 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms