Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LTBRP36941 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LTBRP36941 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
LTBRP36941 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LTBRP36941 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LTBRP36941 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LTBRP36941 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
LTBRP36941 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
LTBRP36941 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LTBRP36941 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LTBRP36941 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LTBRP36941 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LTBRP36941 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LTBRP36941 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LTBRP36941 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LTBRP36941 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LTBRP36941 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LTBRP36941 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LTBRP36941 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
LTBRP36941 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LTBRP36941 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LTBRP36941 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LTBRP36941 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LTBRP36941 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LTBRP36941 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LTBRP36941 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
LTBRP36941 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LTBRP36941 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LTBRP36941 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LTBRP36941 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
LTBRP36941 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
LTBRP36941 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LTBRP36941 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LTBRP36941 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LTBRP36941 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LTBRP36941 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LTBRP36941 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LTBRP36941 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LTBRP36941 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LTBRP36941 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LTBRP36941 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
LTBRP36941 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LTBRP36941 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LTBRP36941 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
LTBRP36941 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LTBRP36941 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
LTBRP36941 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LTBRP36941 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LTBRP36941 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LTBRP36941 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LTBRP36941 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LTBRP36941 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LTBRP36941 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LTBRP36941 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LTBRP36941 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LTBRP36941 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LTBRP36941 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LTBRP36941 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
LTBRP36941 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LTBRP36941 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
LTBRP36941 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LTBRP36941 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LTBRP36941 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LTBRP36941 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LTBRP36941 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LTBRP36941 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LTBRP36941 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LTBRP36941 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LTBRP36941 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LTBRP36941 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LTBRP36941 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LTBRP36941 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LTBRP36941 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LTBRP36941 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LTBRP36941 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
LTBRP36941 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LTBRP36941 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LTBRP36941 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LTBRP36941 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
LTBRP36941 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LTBRP36941 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LTBRP36941 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LTBRP36941 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LTBRP36941 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
LTBRP36941 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LTBRP36941 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LTBRP36941 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LTBRP36941 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
LTBRP36941 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LTBRP36941 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LTBRP36941 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LTBRP36941 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LTBRP36941 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LTBRP36941 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LTBRP36941 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LTBRP36941 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LTBRP36941 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LTBRP36941 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LTBRP36941 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LTBRP36941 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms