Protein–RNA interactions for Protein: P33121

ACSL1, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL1P33121 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACSL1P33121 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACSL1P33121 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSL1P33121 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSL1P33121 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSL1P33121 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSL1P33121 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSL1P33121 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSL1P33121 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSL1P33121 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSL1P33121 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSL1P33121 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSL1P33121 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSL1P33121 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSL1P33121 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSL1P33121 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSL1P33121 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSL1P33121 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSL1P33121 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSL1P33121 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSL1P33121 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSL1P33121 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSL1P33121 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSL1P33121 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSL1P33121 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSL1P33121 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSL1P33121 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSL1P33121 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSL1P33121 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSL1P33121 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSL1P33121 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSL1P33121 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSL1P33121 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSL1P33121 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSL1P33121 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSL1P33121 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSL1P33121 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSL1P33121 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSL1P33121 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSL1P33121 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSL1P33121 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSL1P33121 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSL1P33121 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSL1P33121 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSL1P33121 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSL1P33121 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSL1P33121 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSL1P33121 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSL1P33121 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSL1P33121 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSL1P33121 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSL1P33121 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSL1P33121 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSL1P33121 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSL1P33121 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSL1P33121 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSL1P33121 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSL1P33121 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSL1P33121 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSL1P33121 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSL1P33121 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSL1P33121 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSL1P33121 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSL1P33121 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSL1P33121 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSL1P33121 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSL1P33121 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSL1P33121 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSL1P33121 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSL1P33121 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSL1P33121 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSL1P33121 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSL1P33121 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSL1P33121 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSL1P33121 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSL1P33121 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSL1P33121 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSL1P33121 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSL1P33121 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSL1P33121 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSL1P33121 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSL1P33121 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSL1P33121 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSL1P33121 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSL1P33121 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACSL1P33121 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACSL1P33121 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACSL1P33121 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACSL1P33121 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACSL1P33121 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACSL1P33121 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACSL1P33121 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACSL1P33121 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACSL1P33121 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACSL1P33121 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACSL1P33121 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACSL1P33121 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACSL1P33121 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACSL1P33121 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACSL1P33121 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms