Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.02■□□□□ -0
OTX2P32243 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
OTX2P32243 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
OTX2P32243 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
OTX2P32243 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
OTX2P32243 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
OTX2P32243 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
OTX2P32243 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
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OTX2P32243 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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OTX2P32243 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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OTX2P32243 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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OTX2P32243 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
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OTX2P32243 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
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OTX2P32243 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
OTX2P32243 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15□□□□□ -0.01
OTX2P32243 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
OTX2P32243 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
OTX2P32243 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
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