Protein–RNA interactions for Protein: P07711

CTSL, Cathepsin L1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSLP07711 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSLP07711 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTSLP07711 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTSLP07711 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTSLP07711 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTSLP07711 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CTSLP07711 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTSLP07711 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTSLP07711 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTSLP07711 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CTSLP07711 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTSLP07711 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTSLP07711 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTSLP07711 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTSLP07711 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTSLP07711 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTSLP07711 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTSLP07711 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTSLP07711 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CTSLP07711 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTSLP07711 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTSLP07711 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CTSLP07711 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTSLP07711 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTSLP07711 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTSLP07711 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTSLP07711 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTSLP07711 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTSLP07711 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTSLP07711 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTSLP07711 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTSLP07711 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTSLP07711 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTSLP07711 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTSLP07711 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTSLP07711 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTSLP07711 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTSLP07711 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTSLP07711 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTSLP07711 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTSLP07711 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTSLP07711 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTSLP07711 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CTSLP07711 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTSLP07711 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTSLP07711 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTSLP07711 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTSLP07711 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTSLP07711 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTSLP07711 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTSLP07711 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CTSLP07711 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CTSLP07711 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTSLP07711 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CTSLP07711 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTSLP07711 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTSLP07711 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTSLP07711 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTSLP07711 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTSLP07711 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTSLP07711 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTSLP07711 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CTSLP07711 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTSLP07711 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTSLP07711 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTSLP07711 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTSLP07711 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CTSLP07711 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTSLP07711 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTSLP07711 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTSLP07711 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTSLP07711 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTSLP07711 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTSLP07711 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTSLP07711 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTSLP07711 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTSLP07711 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTSLP07711 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTSLP07711 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTSLP07711 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTSLP07711 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTSLP07711 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSLP07711 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSLP07711 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSLP07711 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSLP07711 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSLP07711 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSLP07711 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSLP07711 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSLP07711 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSLP07711 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSLP07711 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSLP07711 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSLP07711 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSLP07711 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSLP07711 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSLP07711 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSLP07711 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSLP07711 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTSLP07711 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms