Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2U6

LINC00597, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00597, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00597Q9H2U6 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00597Q9H2U6 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00597Q9H2U6 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00597Q9H2U6 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00597Q9H2U6 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00597Q9H2U6 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00597Q9H2U6 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00597Q9H2U6 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00597Q9H2U6 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00597Q9H2U6 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00597Q9H2U6 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00597Q9H2U6 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00597Q9H2U6 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00597Q9H2U6 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00597Q9H2U6 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00597Q9H2U6 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00597Q9H2U6 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00597Q9H2U6 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00597Q9H2U6 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00597Q9H2U6 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00597Q9H2U6 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00597Q9H2U6 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00597Q9H2U6 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00597Q9H2U6 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00597Q9H2U6 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00597Q9H2U6 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00597Q9H2U6 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00597Q9H2U6 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00597Q9H2U6 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00597Q9H2U6 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00597Q9H2U6 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00597Q9H2U6 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00597Q9H2U6 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00597Q9H2U6 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00597Q9H2U6 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00597Q9H2U6 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00597Q9H2U6 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00597Q9H2U6 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00597Q9H2U6 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00597Q9H2U6 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00597Q9H2U6 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00597Q9H2U6 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00597Q9H2U6 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00597Q9H2U6 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00597Q9H2U6 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00597Q9H2U6 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00597Q9H2U6 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00597Q9H2U6 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00597Q9H2U6 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00597Q9H2U6 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00597Q9H2U6 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00597Q9H2U6 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00597Q9H2U6 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00597Q9H2U6 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00597Q9H2U6 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00597Q9H2U6 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00597Q9H2U6 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00597Q9H2U6 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00597Q9H2U6 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00597Q9H2U6 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00597Q9H2U6 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00597Q9H2U6 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00597Q9H2U6 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00597Q9H2U6 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00597Q9H2U6 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00597Q9H2U6 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00597Q9H2U6 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00597Q9H2U6 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00597Q9H2U6 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00597Q9H2U6 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00597Q9H2U6 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00597Q9H2U6 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00597Q9H2U6 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00597Q9H2U6 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00597Q9H2U6 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00597Q9H2U6 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00597Q9H2U6 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00597Q9H2U6 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00597Q9H2U6 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00597Q9H2U6 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00597Q9H2U6 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00597Q9H2U6 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00597Q9H2U6 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00597Q9H2U6 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00597Q9H2U6 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00597Q9H2U6 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00597Q9H2U6 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00597Q9H2U6 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00597Q9H2U6 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00597Q9H2U6 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00597Q9H2U6 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00597Q9H2U6 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00597Q9H2U6 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
LINC00597Q9H2U6 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
LINC00597Q9H2U6 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
LINC00597Q9H2U6 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
LINC00597Q9H2U6 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.22
LINC00597Q9H2U6 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
LINC00597Q9H2U6 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00597Q9H2U6 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79 ms