Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SCAPERQ9BY12 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SCAPERQ9BY12 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCAPERQ9BY12 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCAPERQ9BY12 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCAPERQ9BY12 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCAPERQ9BY12 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCAPERQ9BY12 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCAPERQ9BY12 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCAPERQ9BY12 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCAPERQ9BY12 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCAPERQ9BY12 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCAPERQ9BY12 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCAPERQ9BY12 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCAPERQ9BY12 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCAPERQ9BY12 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCAPERQ9BY12 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCAPERQ9BY12 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCAPERQ9BY12 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCAPERQ9BY12 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCAPERQ9BY12 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCAPERQ9BY12 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCAPERQ9BY12 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCAPERQ9BY12 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCAPERQ9BY12 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCAPERQ9BY12 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCAPERQ9BY12 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCAPERQ9BY12 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCAPERQ9BY12 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCAPERQ9BY12 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCAPERQ9BY12 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SCAPERQ9BY12 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCAPERQ9BY12 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCAPERQ9BY12 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCAPERQ9BY12 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCAPERQ9BY12 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCAPERQ9BY12 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCAPERQ9BY12 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SCAPERQ9BY12 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCAPERQ9BY12 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCAPERQ9BY12 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCAPERQ9BY12 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCAPERQ9BY12 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCAPERQ9BY12 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCAPERQ9BY12 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCAPERQ9BY12 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCAPERQ9BY12 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SCAPERQ9BY12 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCAPERQ9BY12 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SCAPERQ9BY12 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SCAPERQ9BY12 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCAPERQ9BY12 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCAPERQ9BY12 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SCAPERQ9BY12 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SCAPERQ9BY12 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SCAPERQ9BY12 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SCAPERQ9BY12 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SCAPERQ9BY12 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SCAPERQ9BY12 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SCAPERQ9BY12 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SCAPERQ9BY12 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SCAPERQ9BY12 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SCAPERQ9BY12 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SCAPERQ9BY12 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SCAPERQ9BY12 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SCAPERQ9BY12 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SCAPERQ9BY12 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SCAPERQ9BY12 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCAPERQ9BY12 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCAPERQ9BY12 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCAPERQ9BY12 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCAPERQ9BY12 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCAPERQ9BY12 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCAPERQ9BY12 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SCAPERQ9BY12 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCAPERQ9BY12 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SCAPERQ9BY12 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCAPERQ9BY12 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCAPERQ9BY12 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCAPERQ9BY12 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCAPERQ9BY12 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCAPERQ9BY12 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCAPERQ9BY12 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCAPERQ9BY12 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SCAPERQ9BY12 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCAPERQ9BY12 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCAPERQ9BY12 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SCAPERQ9BY12 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCAPERQ9BY12 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCAPERQ9BY12 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCAPERQ9BY12 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCAPERQ9BY12 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCAPERQ9BY12 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCAPERQ9BY12 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCAPERQ9BY12 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCAPERQ9BY12 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCAPERQ9BY12 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCAPERQ9BY12 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCAPERQ9BY12 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCAPERQ9BY12 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms