Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUI4

POLR3C, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3CQ9BUI4 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR3CQ9BUI4 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR3CQ9BUI4 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR3CQ9BUI4 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR3CQ9BUI4 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR3CQ9BUI4 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR3CQ9BUI4 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR3CQ9BUI4 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR3CQ9BUI4 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR3CQ9BUI4 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR3CQ9BUI4 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR3CQ9BUI4 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR3CQ9BUI4 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR3CQ9BUI4 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR3CQ9BUI4 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR3CQ9BUI4 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR3CQ9BUI4 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR3CQ9BUI4 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR3CQ9BUI4 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR3CQ9BUI4 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR3CQ9BUI4 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR3CQ9BUI4 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR3CQ9BUI4 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR3CQ9BUI4 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR3CQ9BUI4 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR3CQ9BUI4 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR3CQ9BUI4 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR3CQ9BUI4 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR3CQ9BUI4 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR3CQ9BUI4 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR3CQ9BUI4 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR3CQ9BUI4 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR3CQ9BUI4 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR3CQ9BUI4 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR3CQ9BUI4 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR3CQ9BUI4 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR3CQ9BUI4 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR3CQ9BUI4 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR3CQ9BUI4 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR3CQ9BUI4 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR3CQ9BUI4 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR3CQ9BUI4 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR3CQ9BUI4 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR3CQ9BUI4 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR3CQ9BUI4 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms