Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERPUD2Q9BSE4 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms