Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3P4

VPS8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS8Q8N3P4 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VPS8Q8N3P4 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VPS8Q8N3P4 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VPS8Q8N3P4 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VPS8Q8N3P4 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
VPS8Q8N3P4 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VPS8Q8N3P4 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
VPS8Q8N3P4 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
VPS8Q8N3P4 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VPS8Q8N3P4 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VPS8Q8N3P4 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VPS8Q8N3P4 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
VPS8Q8N3P4 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VPS8Q8N3P4 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VPS8Q8N3P4 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VPS8Q8N3P4 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
VPS8Q8N3P4 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
VPS8Q8N3P4 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
VPS8Q8N3P4 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VPS8Q8N3P4 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
VPS8Q8N3P4 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
VPS8Q8N3P4 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
VPS8Q8N3P4 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
VPS8Q8N3P4 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VPS8Q8N3P4 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VPS8Q8N3P4 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
VPS8Q8N3P4 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VPS8Q8N3P4 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
VPS8Q8N3P4 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
VPS8Q8N3P4 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VPS8Q8N3P4 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VPS8Q8N3P4 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VPS8Q8N3P4 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VPS8Q8N3P4 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VPS8Q8N3P4 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VPS8Q8N3P4 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VPS8Q8N3P4 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VPS8Q8N3P4 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VPS8Q8N3P4 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VPS8Q8N3P4 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VPS8Q8N3P4 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
VPS8Q8N3P4 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VPS8Q8N3P4 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VPS8Q8N3P4 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VPS8Q8N3P4 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
VPS8Q8N3P4 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VPS8Q8N3P4 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VPS8Q8N3P4 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VPS8Q8N3P4 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VPS8Q8N3P4 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VPS8Q8N3P4 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VPS8Q8N3P4 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
VPS8Q8N3P4 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
VPS8Q8N3P4 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
VPS8Q8N3P4 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
VPS8Q8N3P4 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VPS8Q8N3P4 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VPS8Q8N3P4 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VPS8Q8N3P4 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VPS8Q8N3P4 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
VPS8Q8N3P4 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
VPS8Q8N3P4 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
VPS8Q8N3P4 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
VPS8Q8N3P4 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
VPS8Q8N3P4 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
VPS8Q8N3P4 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VPS8Q8N3P4 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VPS8Q8N3P4 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VPS8Q8N3P4 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
VPS8Q8N3P4 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VPS8Q8N3P4 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
VPS8Q8N3P4 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
VPS8Q8N3P4 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VPS8Q8N3P4 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VPS8Q8N3P4 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VPS8Q8N3P4 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VPS8Q8N3P4 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VPS8Q8N3P4 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VPS8Q8N3P4 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VPS8Q8N3P4 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VPS8Q8N3P4 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VPS8Q8N3P4 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VPS8Q8N3P4 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VPS8Q8N3P4 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VPS8Q8N3P4 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
VPS8Q8N3P4 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VPS8Q8N3P4 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VPS8Q8N3P4 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VPS8Q8N3P4 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VPS8Q8N3P4 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VPS8Q8N3P4 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VPS8Q8N3P4 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VPS8Q8N3P4 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VPS8Q8N3P4 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VPS8Q8N3P4 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VPS8Q8N3P4 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VPS8Q8N3P4 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VPS8Q8N3P4 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
VPS8Q8N3P4 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
VPS8Q8N3P4 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
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