Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 TASP1-201ENST00000337743 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 CYB561-202ENST00000392975 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 MEST-204ENST00000393187 2380 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 FUT8-202ENST00000358307 2664 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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