Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms