Protein–RNA interactions for Protein: P62136

PPP1CA, Serine/threonine-protein phosphatase PP1-alpha catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1CAP62136 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.3 ms