Protein–RNA interactions for Protein: P51157

RAB28, Ras-related protein Rab-28, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB28P51157 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB28P51157 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB28P51157 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB28P51157 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB28P51157 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB28P51157 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB28P51157 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB28P51157 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB28P51157 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB28P51157 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB28P51157 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB28P51157 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB28P51157 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB28P51157 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB28P51157 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB28P51157 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB28P51157 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB28P51157 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB28P51157 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB28P51157 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB28P51157 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB28P51157 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB28P51157 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB28P51157 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB28P51157 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB28P51157 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB28P51157 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB28P51157 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB28P51157 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB28P51157 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB28P51157 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB28P51157 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB28P51157 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB28P51157 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB28P51157 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB28P51157 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB28P51157 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB28P51157 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB28P51157 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB28P51157 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB28P51157 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB28P51157 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB28P51157 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB28P51157 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB28P51157 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB28P51157 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB28P51157 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB28P51157 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB28P51157 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB28P51157 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB28P51157 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB28P51157 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB28P51157 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB28P51157 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB28P51157 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB28P51157 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB28P51157 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB28P51157 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB28P51157 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB28P51157 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB28P51157 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB28P51157 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAB28P51157 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAB28P51157 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAB28P51157 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAB28P51157 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAB28P51157 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAB28P51157 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAB28P51157 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAB28P51157 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAB28P51157 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAB28P51157 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAB28P51157 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAB28P51157 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB28P51157 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB28P51157 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB28P51157 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB28P51157 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB28P51157 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB28P51157 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB28P51157 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB28P51157 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB28P51157 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB28P51157 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB28P51157 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB28P51157 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB28P51157 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB28P51157 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB28P51157 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB28P51157 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB28P51157 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB28P51157 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB28P51157 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB28P51157 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB28P51157 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB28P51157 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB28P51157 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB28P51157 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB28P51157 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB28P51157 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms